SCAYLE acogerá la séptima edición del curso de iniciación al análisis de datos de RNA-SEQ
Se celebrará de 8 a 12 de julio y permitirá a los participantes adquirir formación básica para el manejo e interpretación de datos de expresión génica global.
El Aula de Formación de SCAYLE- Supercomputación de Castilla y León (Campus de Vegazana de la Universidad de León) acogerá de 8 a 12 de julio la séptima edición del curso práctico de ‘Iniciación al uso de la supercomputación aplicado al análisis de datos procedentes de Next Generation Sequencing (RNA-Seq)’, que ha ofertado 20 plazas dirigidas a investigadores interesados en estudios genómicos, profesionales del sector de las Ciencias Computacionales, Biología y/o Biotecnología relacionados con el diagnóstico genético, y a alumnos Universitarios (titulaciones técnicas del ámbito experimental y/o económico) de posgrado y, en general, cualquier persona afín a la temática tanto en la dimensión de la investigación, como de la innovación y el desarrollo.
El curso proporcionará a quienes lo realicen una formación básica para el manejo e interpretación de datos de expresión génica global procedentes de Next Generation Sequencing (RNA-Seq).
En las diferentes sesiones se explicarán las bases teóricas de la generación de los datos y del proceso de análisis, y se trabajará con con datos reales de expresión génica en los que se realizará el control de calidad, el alineamiento frente al genoma de referencia, ensamblado, cuantificación y normalización de la expresión génica, análisis de expresión diferencial y análisis de enriquecimiento funcional.
MANEJO DE SOFTWARE LIBRE EN EL SUPERCOMPUTADOR
Se trata de un curso muy especializado, de 36 horas de duración, que se celebrará bajo la dirección de Ruth Alonso Martínez (Responsable Administrativo y de Formación del Centro de Supercomputación de Castilla y León), y de Juan José Arranz Santos (Profesor de la Facultad de Veterinaria de la ULE).
Al término de la formación los participantes adquirirán la capacidad de establecer un diseño experimental para el análisis de expresión génica diferencial utilizando datos del transcriptoma completo mediante técnicas NGS (RNA-Seq). También serán capaces de manejar software libre para el análisis de RNA-Seq, interpretarán y podrán representar los resultados de expresión diferencial, y tendrán conocimiento de una pipeline de análisis de expresión diferencial en experimentos que utilizan RNA-seq.
El precio de la matrícula se ha fijado en 450 euros, cantidad que se reduce a 350 para los estudiantes de la ULE y para las personas que se encuentren en situación de desempleo. Las inscripciones se pueden llevar a cabo a través del siguiente ENLACE. Hay que señalar que el curso permitirá reconocer 1’8 créditos ECTS.
(Imágenes: 1 - Ilustración que muestra una cadena de ADN 2.- Cartel anunciador del curso 3.- Logotipo de SCAYLE - Centro de Supercomputación de CyL 4.- Edificio que alberga la sede de SCAYLE, en el campus de Vegazana de la ULE)
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